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【第一參賽人/留學(xué)人員】李旦
【留學(xué)國(guó)家】美國(guó)
【技術(shù)領(lǐng)域】生物技術(shù)與大健康
【參賽屆次】第6屆
【所獲獎(jiǎng)項(xiàng)】入圍
【項(xiàng)目簡(jiǎn)介】
DNA甲基化是一種表觀調(diào)控修飾，它在不改變堿基序列的情況下，參與生物過(guò)程的各類調(diào)控。據(jù)臨床研究表明癌細(xì)胞也擁有一系列特殊的甲基化標(biāo)記，形成了癌細(xì)胞獨(dú)有的甲基化ID。如果在血漿游離DNA（cfDNA）中搜尋這些ID，我們就有可能檢測(cè)到癌癥的存在，甚至是提前發(fā)現(xiàn)癌癥，這是利用血漿游離腫瘤DNA（ctDNA）甲基化進(jìn)行癌癥早診的原理，也是本項(xiàng)目主要研究及攻破的重點(diǎn)。基于團(tuán)隊(duì)之前研發(fā)的DNA和RNA免疫共沉淀方法基礎(chǔ)上，我們采用DNA甲基化的捕獲抗體將全基因組上的DNA甲基化特異區(qū)域進(jìn)行集中富集，然后建庫(kù)、測(cè)序捕獲的甲基化DNA序列，通過(guò)生物信息學(xué)方法分析全基因組的甲基化趨勢(shì)，機(jī)器學(xué)習(xí)構(gòu)建甲基化模型，確定腫瘤細(xì)胞發(fā)生區(qū)域及發(fā)生時(shí)期。此外，采用傳統(tǒng)的Bisulf-seq或者Bisulf-qPCR方法對(duì)該方法的結(jié)果進(jìn)行驗(yàn)證和優(yōu)化。該方法計(jì)劃將在7個(gè)疾病部位（卵巢癌、前列腺癌、肺癌、乳腺癌、胰腺癌、結(jié)直腸癌、和膀胱癌）的患者腫瘤樣本和來(lái)自健康供者的樣本中進(jìn)行檢測(cè)，分析血漿游離cfDNA的甲基化模式并用來(lái)追蹤癌癥起源和類型。
【展開(kāi)】
【收起】